审计部门通过对医疗设备的运行情况和使用效益进行绩效分析、评价，向管理层准确、及时地反映医院当前医疗设备的实际运行状况、效益情况和存在问题，提出审计建议，为院领导决策和管理提供可靠的依据和参考，同时为改善经营管理、提高设备社会效益和经济效益提供重要保证。  

审计部门在对医疗设备进行运行成本和使用效益的分析评价过程中，需科学、合理运用分析方法和评价指标。常用的经济效益分析方法有：本量利分析法、投入产出法、动态分析法、对比分析法、投资回收期法、投资收益率法、净现值法等。评价指标有：经济效益评价指标(如设备年收益、设备投资利润率、设备日均业务量、设备投资回收期、单台设备利用率、设备利用时数、设备完好率等);社会效益评价指标(如使用该项设备诊疗的病人满意度、检查阳性率、治疗有效率、设备对诊疗工作的贡献、设备对教学工作的贡献、设备对科研工作的贡献等)。对医疗设备的经济性、效率性、效果性进行综合分析，科学合理地对医疗设备购置的经济效益和社会效益进行审计评价。